Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MTHFD1P11586 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms