Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DMDP11532 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DMDP11532 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DMDP11532 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DMDP11532 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DMDP11532 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DMDP11532 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DMDP11532 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DMDP11532 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMDP11532 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMDP11532 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMDP11532 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMDP11532 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMDP11532 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMDP11532 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMDP11532 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMDP11532 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMDP11532 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMDP11532 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMDP11532 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMDP11532 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DMDP11532 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DMDP11532 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DMDP11532 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DMDP11532 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DMDP11532 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DMDP11532 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DMDP11532 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DMDP11532 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DMDP11532 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DMDP11532 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DMDP11532 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DMDP11532 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DMDP11532 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DMDP11532 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DMDP11532 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DMDP11532 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DMDP11532 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DMDP11532 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DMDP11532 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DMDP11532 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DMDP11532 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DMDP11532 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DMDP11532 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DMDP11532 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DMDP11532 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DMDP11532 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DMDP11532 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DMDP11532 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DMDP11532 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DMDP11532 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DMDP11532 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DMDP11532 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DMDP11532 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DMDP11532 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DMDP11532 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DMDP11532 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DMDP11532 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DMDP11532 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DMDP11532 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DMDP11532 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DMDP11532 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DMDP11532 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DMDP11532 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DMDP11532 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DMDP11532 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DMDP11532 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DMDP11532 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DMDP11532 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DMDP11532 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DMDP11532 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DMDP11532 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DMDP11532 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DMDP11532 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DMDP11532 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DMDP11532 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DMDP11532 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DMDP11532 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DMDP11532 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DMDP11532 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DMDP11532 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DMDP11532 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DMDP11532 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DMDP11532 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DMDP11532 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DMDP11532 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DMDP11532 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DMDP11532 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DMDP11532 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DMDP11532 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DMDP11532 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DMDP11532 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DMDP11532 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DMDP11532 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DMDP11532 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DMDP11532 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DMDP11532 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DMDP11532 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DMDP11532 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DMDP11532 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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