Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms