Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRPF40AO75400 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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