Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ3A6PVS8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ3A6PVS8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms