Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC78A2IDD5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC78A2IDD5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms