Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CAPN7Q9Y6W3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN7Q9Y6W3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms