Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYVE1Q9Y5Y7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms