Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB5Q9Y5E4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms