Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NOP58Q9Y2X3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP58Q9Y2X3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms