Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACSL6Q9UKU0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSL6Q9UKU0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms