Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPREB3Q9UKI3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms