Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGGBP1Q9UFW8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGGBP1Q9UFW8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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