Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCLK3Q9C098 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLK3Q9C098 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms