Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ19

ANKRD60, Ankyrin repeat domain-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD60Q9BZ19 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD60Q9BZ19 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD60Q9BZ19 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms