Protein–RNA interactions for Protein: Q99835

SMO, Smoothened homolog, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOQ99835 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMOQ99835 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMOQ99835 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMOQ99835 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMOQ99835 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMOQ99835 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMOQ99835 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMOQ99835 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMOQ99835 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMOQ99835 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMOQ99835 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMOQ99835 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMOQ99835 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMOQ99835 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMOQ99835 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMOQ99835 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMOQ99835 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMOQ99835 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMOQ99835 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMOQ99835 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMOQ99835 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMOQ99835 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMOQ99835 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMOQ99835 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMOQ99835 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMOQ99835 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMOQ99835 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMOQ99835 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMOQ99835 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMOQ99835 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMOQ99835 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOQ99835 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOQ99835 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOQ99835 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOQ99835 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOQ99835 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOQ99835 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOQ99835 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOQ99835 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOQ99835 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOQ99835 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOQ99835 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOQ99835 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMOQ99835 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMOQ99835 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMOQ99835 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMOQ99835 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMOQ99835 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMOQ99835 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMOQ99835 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMOQ99835 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMOQ99835 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMOQ99835 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMOQ99835 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMOQ99835 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMOQ99835 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMOQ99835 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMOQ99835 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMOQ99835 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMOQ99835 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMOQ99835 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMOQ99835 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMOQ99835 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMOQ99835 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMOQ99835 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMOQ99835 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMOQ99835 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMOQ99835 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMOQ99835 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMOQ99835 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMOQ99835 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMOQ99835 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMOQ99835 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMOQ99835 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMOQ99835 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMOQ99835 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMOQ99835 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMOQ99835 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMOQ99835 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMOQ99835 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMOQ99835 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOQ99835 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOQ99835 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOQ99835 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOQ99835 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOQ99835 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOQ99835 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOQ99835 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOQ99835 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOQ99835 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOQ99835 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOQ99835 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOQ99835 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOQ99835 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOQ99835 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOQ99835 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOQ99835 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOQ99835 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOQ99835 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMOQ99835 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms