Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C8orf48Q96LL4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C8orf48Q96LL4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms