Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms