Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCD7Q8N8D1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCD7Q8N8D1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms