Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC82Q8N4S0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC82Q8N4S0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms