Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP30Q70CQ3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP30Q70CQ3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP30Q70CQ3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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