Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

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Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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RRN3P1Q2M238 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RRN3P1Q2M238 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RRN3P1Q2M238 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RRN3P1Q2M238 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RRN3P1Q2M238 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RRN3P1Q2M238 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RRN3P1Q2M238 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RRN3P1Q2M238 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RRN3P1Q2M238 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RRN3P1Q2M238 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RRN3P1Q2M238 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RRN3P1Q2M238 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RRN3P1Q2M238 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RRN3P1Q2M238 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RRN3P1Q2M238 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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RRN3P1Q2M238 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RRN3P1Q2M238 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RRN3P1Q2M238 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RRN3P1Q2M238 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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RRN3P1Q2M238 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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RRN3P1Q2M238 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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RRN3P1Q2M238 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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RRN3P1Q2M238 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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RRN3P1Q2M238 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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RRN3P1Q2M238 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RRN3P1Q2M238 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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