Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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EXT1Q16394 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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EXT1Q16394 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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EXT1Q16394 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EXT1Q16394 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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