Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPNMBQ14956 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPNMBQ14956 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
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