Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNX3Q13761 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNX3Q13761 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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