Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALCOCO2Q13137 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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