Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCE1P61221 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ABCE1P61221 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCE1P61221 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ABCE1P61221 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCE1P61221 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCE1P61221 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCE1P61221 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCE1P61221 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCE1P61221 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCE1P61221 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCE1P61221 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCE1P61221 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCE1P61221 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCE1P61221 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCE1P61221 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCE1P61221 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCE1P61221 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCE1P61221 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCE1P61221 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCE1P61221 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCE1P61221 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCE1P61221 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms