Protein–RNA interactions for Protein: P26368

U2AF2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2P26368 PPP2R2A-221ENST00000523964 567 ntTSL 42.64□□□□□ -1.991e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 USP8-218ENST00000561330 815 ntTSL 1 (best)2.24□□□□□ -2.051e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 USP8-211ENST00000560527 535 ntTSL 42.16□□□□□ -2.061e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 PPP2R2A-217ENST00000522482 576 ntTSL 42.06□□□□□ -2.083e-11■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 PPP2R2A-212ENST00000520438 409 ntTSL 31.93□□□□□ -2.11e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.11e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 DENND5A-204ENST00000526523 572 ntTSL 30.92□□□□□ -2.261e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 DMTF1-203ENST00000412139 4460 ntTSL 25.67□□□□□ -1.51e-8■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.143e-9■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 SNX27-202ENST00000368841 7070 ntTSL 1 (best)20.33■□□□□ 0.853e-9■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.773e-9■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 SNX27-201ENST00000368838 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.793e-9■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 GPATCH8-201ENST00000335500 8109 ntTSL 29.71□□□□□ -0.856e-9■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 GRB10-217ENST00000473696 1065 ntTSL 416.1■□□□□ 0.174e-9■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 GRB10-203ENST00000398810 4785 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.74e-9■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 TP53BP1-204ENST00000411772 3976 ntTSL 510.75□□□□□ -0.696e-9■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 PELP1-206ENST00000571170 555 ntTSL 212.3□□□□□ -0.443e-8■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 GCKR-205ENST00000472290 1302 ntTSL 1 (best)15.05■□□□□ -01e-6■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 RNPEP-204ENST00000449524 505 ntTSL 35.43□□□□□ -1.543e-20■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 SLC38A2-210ENST00000551405 526 ntTSL 418.01■□□□□ 0.471e-24■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 NFE2L2-205ENST00000430047 451 ntTSL 326.55■■□□□ 1.845e-10■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 NFE2L2-203ENST00000421929 979 ntTSL 1 (best)22.63■■□□□ 1.213e-25■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.715e-10■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 NFE2L2-210ENST00000462023 521 ntTSL 217.35■□□□□ 0.375e-10■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.263e-25■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 NFE2L2-207ENST00000448782 975 ntTSL 1 (best)13.39□□□□□ -0.273e-25■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 NFE2L2-211ENST00000464747 2749 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.415e-10■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 NFE2L2-214ENST00000588123 814 ntTSL 510.63□□□□□ -0.715e-10■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 FMO5-206ENST00000533174 671 ntTSL 47.09□□□□□ -1.275e-12■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.33e-25■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.673e-25■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 NFE2L2-212ENST00000477534 930 ntTSL 1 (best)3.96□□□□□ -1.783e-25■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 NFE2L2-208ENST00000449627 909 ntTSL 43.72□□□□□ -1.813e-25■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 NFE2L2-213ENST00000586532 942 ntTSL 52.67□□□□□ -1.985e-10■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 FGL1-204ENST00000398056 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 MAPK14-206ENST00000474429 823 ntTSL 512.96□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 MAPK14-208ENST00000491957 2777 ntTSL 1 (best)8.72□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 MAPK14-209ENST00000496250 2750 ntTSL 1 (best)7.85□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 CTC1-202ENST00000449476 4797 ntTSL 211.71□□□□□ -0.538e-8■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 CTC1-201ENST00000315684 7021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.888e-8■■■■■ 28.7
U2AF2P26368 TTC9C-201ENST00000294161 1833 ntTSL 1 (best)17.1■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 TTC9C-205ENST00000532583 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 TTC9C-203ENST00000530625 606 ntTSL 510.27□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 TTC9C-202ENST00000316461 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 PPM1B-211ENST00000488866 981 ntTSL 34.27□□□□□ -1.732e-6■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 KBTBD2-206ENST00000477129 695 ntTSL 211.69□□□□□ -0.546e-14■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 GABRE-210ENST00000489333 592 ntTSL 29.94□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 GABRE-212ENST00000495862 238 ntTSL 35.26□□□□□ -1.572e-6■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 SUCO-205ENST00000608566 756 ntTSL 28.67□□□□□ -1.022e-35■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 FUS-203ENST00000474990 827 ntTSL 324.97■■□□□ 1.597e-10■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 NOLC1-204ENST00000464969 2288 ntTSL 213.11□□□□□ -0.315e-7■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 NOLC1-207ENST00000488254 2441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.555e-7■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 NOLC1-209ENST00000605788 3932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.795e-7■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 NOLC1-202ENST00000405356 3967 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.85e-7■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 NOLC1-208ENST00000603946 3217 ntTSL 1 (best)9.24□□□□□ -0.935e-7■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 NOLC1-201ENST00000370007 3727 ntTSL 1 (best)8.8□□□□□ -15e-7■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 NOLC1-203ENST00000461421 777 ntTSL 38.76□□□□□ -1.015e-7■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 EHMT1-248ENST00000637891 1930 ntTSL 519.13■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 EHMT1-214ENST00000488242 789 ntTSL 516.29■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 ZC3H7A-205ENST00000571198 2343 ntTSL 218.11■□□□□ 0.496e-10■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 ZC3H7A-201ENST00000355758 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.476e-10■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.576e-10■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 MON2-206ENST00000547287 569 ntTSL 31.33□□□□□ -2.29e-7■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.554e-9■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 WARS-243ENST00000557722 848 ntTSL 518.45■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.314e-9■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 WARS-229ENST00000556435 528 ntTSL 214.29□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 WARS-202ENST00000355338 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.134e-9■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 WARS-201ENST00000344102 2690 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.534e-9■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 WARS-230ENST00000556504 847 ntTSL 511.71□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 WARS-238ENST00000557135 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.574e-9■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 WARS-204ENST00000392882 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.744e-9■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 WARS-240ENST00000557297 821 ntTSL 37.38□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 WARS-205ENST00000553395 801 ntTSL 54.25□□□□□ -1.731e-6■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.546e-10■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.346e-10■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.176e-10■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 MBNL1-212ENST00000464596 989 ntTSL 59.71□□□□□ -0.866e-10■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.096e-10■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 MBNL1-216ENST00000478535 1451 ntTSL 1 (best)7.78□□□□□ -1.166e-10■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.236e-10■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.246e-10■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.246e-10■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.476e-10■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.636e-10■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.76e-10■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.756e-10■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.796e-10■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.816e-10■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.826e-10■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.374e-12■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 AC106795.2-201ENST00000502514 613 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.54e-12■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 AC106795.2-202ENST00000507072 551 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.654e-12■■■■■ 28.6
U2AF2P26368 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.071e-26■■■■■ 28.5
U2AF2P26368 SRSF3-203ENST00000477442 1095 ntTSL 514.42□□□□□ -0.11e-26■■■■■ 28.5
U2AF2P26368 SRSF3-207ENST00000620389 2655 ntTSL 210.64□□□□□ -0.711e-26■■■■■ 28.5
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