RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397063.8

NFE2L2-202, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NFE2L2, Length 2,651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L2-202ENST00000397063 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.31■■■□□ 2.44
NFE2L2-202ENST00000397063 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.94■■□□□ 1.74
NFE2L2-202ENST00000397063 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.74■■□□□ 1.71
NFE2L2-202ENST00000397063 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
NFE2L2-202ENST00000397063 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
NFE2L2-202ENST00000397063 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.26■■□□□ 1.63
NFE2L2-202ENST00000397063 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.77■■□□□ 1.56
NFE2L2-202ENST00000397063 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.56■■□□□ 1.52
NFE2L2-202ENST00000397063 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.54■■□□□ 1.52
NFE2L2-202ENST00000397063 SCRIBQ14160 1630 aa24.26■■□□□ 1.47
NFE2L2-202ENST00000397063 ABCC9O60706 1549 aa24.17■■□□□ 1.46
NFE2L2-202ENST00000397063 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
NFE2L2-202ENST00000397063 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.91■■□□□ 1.42
NFE2L2-202ENST00000397063 NACADO15069 1562 aa23.81■■□□□ 1.4
NFE2L2-202ENST00000397063 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.78■■□□□ 1.4
NFE2L2-202ENST00000397063 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.74■■□□□ 1.39
NFE2L2-202ENST00000397063 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.73■■□□□ 1.39
NFE2L2-202ENST00000397063 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.63■■□□□ 1.37
NFE2L2-202ENST00000397063 HRCP23327 699 aa23.61■■□□□ 1.37
NFE2L2-202ENST00000397063 TRIM41Q8WV44 630 aa23.53■■□□□ 1.36
NFE2L2-202ENST00000397063 WIZO95785 1651 aa23.51■■□□□ 1.35
NFE2L2-202ENST00000397063 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
NFE2L2-202ENST00000397063 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.34■■□□□ 1.33
NFE2L2-202ENST00000397063 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
NFE2L2-202ENST00000397063 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
NFE2L2-202ENST00000397063 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.25■■□□□ 1.31
NFE2L2-202ENST00000397063 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
NFE2L2-202ENST00000397063 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
NFE2L2-202ENST00000397063 SMARCA4P51532 1647 aa23.12■■□□□ 1.29
NFE2L2-202ENST00000397063 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
NFE2L2-202ENST00000397063 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
NFE2L2-202ENST00000397063 CCDC88BA6NC98 1476 aa23■■□□□ 1.27
NFE2L2-202ENST00000397063 ABCC8Q09428 1581 aa22.99■■□□□ 1.27
NFE2L2-202ENST00000397063 SMARCA2P51531 1590 aa22.97■■□□□ 1.27
NFE2L2-202ENST00000397063 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.93■■□□□ 1.26
NFE2L2-202ENST00000397063 SOGA1O94964 1423 aa22.73■■□□□ 1.23
NFE2L2-202ENST00000397063 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.66■■□□□ 1.22
NFE2L2-202ENST00000397063 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.61■■□□□ 1.21
NFE2L2-202ENST00000397063 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
NFE2L2-202ENST00000397063 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.54■■□□□ 1.2
NFE2L2-202ENST00000397063 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
NFE2L2-202ENST00000397063 CEP162Q5TB80 1403 aa22.53■■□□□ 1.2
NFE2L2-202ENST00000397063 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.51■■□□□ 1.19
NFE2L2-202ENST00000397063 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
NFE2L2-202ENST00000397063 SYNJ1O43426 1573 aa22.47■■□□□ 1.19
NFE2L2-202ENST00000397063 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
NFE2L2-202ENST00000397063 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.44■■□□□ 1.18
NFE2L2-202ENST00000397063 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
NFE2L2-202ENST00000397063 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
NFE2L2-202ENST00000397063 EEA1Q15075 1411 aa22.41■■□□□ 1.18
NFE2L2-202ENST00000397063 GOLGA3Q08378 1498 aa22.34■■□□□ 1.17
NFE2L2-202ENST00000397063 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
NFE2L2-202ENST00000397063 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.21■■□□□ 1.15
NFE2L2-202ENST00000397063 KIF21BO75037 1637 aa22.19■■□□□ 1.14
NFE2L2-202ENST00000397063 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.16■■□□□ 1.14
NFE2L2-202ENST00000397063 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
NFE2L2-202ENST00000397063 TOP2BQ02880 1626 aa22.12■■□□□ 1.13
NFE2L2-202ENST00000397063 CLIP1P30622 1438 aa22.11■■□□□ 1.13
NFE2L2-202ENST00000397063 NCAPD3P42695 1498 aa22.07■■□□□ 1.12
NFE2L2-202ENST00000397063 HMGXB3Q12766 1538 aa22.04■■□□□ 1.12
NFE2L2-202ENST00000397063 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.04■■□□□ 1.12
NFE2L2-202ENST00000397063 CUX1P39880 1505 aa21.99■■□□□ 1.11
NFE2L2-202ENST00000397063 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.98■■□□□ 1.11
NFE2L2-202ENST00000397063 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
NFE2L2-202ENST00000397063 CFTRP13569 1480 aa21.89■■□□□ 1.09
NFE2L2-202ENST00000397063 PRXQ9BXM0 1461 aa21.89■■□□□ 1.09
NFE2L2-202ENST00000397063 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.83■■□□□ 1.08
NFE2L2-202ENST00000397063 APLP2Q06481 763 aa21.83■■□□□ 1.08
NFE2L2-202ENST00000397063 ARAP1Q96P48 1450 aa21.81■■□□□ 1.08
NFE2L2-202ENST00000397063 KIF27Q86VH2 1401 aa21.78■■□□□ 1.08
NFE2L2-202ENST00000397063 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
NFE2L2-202ENST00000397063 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
NFE2L2-202ENST00000397063 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
NFE2L2-202ENST00000397063 PRDM2Q13029 1718 aa21.7■■□□□ 1.06
NFE2L2-202ENST00000397063 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.66■■□□□ 1.06
NFE2L2-202ENST00000397063 CUX2O14529 1486 aa21.66■■□□□ 1.06
NFE2L2-202ENST00000397063 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.63■■□□□ 1.05
NFE2L2-202ENST00000397063 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.63■■□□□ 1.05
NFE2L2-202ENST00000397063 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
NFE2L2-202ENST00000397063 IGF1RP08069 1367 aa21.6■■□□□ 1.05
NFE2L2-202ENST00000397063 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.59■■□□□ 1.05
NFE2L2-202ENST00000397063 NEUROD1Q13562 356 aa21.58■■□□□ 1.04
NFE2L2-202ENST00000397063 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
NFE2L2-202ENST00000397063 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.5■■□□□ 1.03
NFE2L2-202ENST00000397063 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.48■■□□□ 1.03
NFE2L2-202ENST00000397063 NESP48681 1621 aa21.46■■□□□ 1.03
NFE2L2-202ENST00000397063 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
NFE2L2-202ENST00000397063 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NFE2L2-202ENST00000397063 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.44■■□□□ 1.02
NFE2L2-202ENST00000397063 ITGAEP38570 1179 aa21.42■■□□□ 1.02
NFE2L2-202ENST00000397063 P3H3Q8IVL6 736 aa21.4■■□□□ 1.02
NFE2L2-202ENST00000397063 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.38■■□□□ 1.01
NFE2L2-202ENST00000397063 MIER1Q8N108 512 aa21.38■■□□□ 1.01
NFE2L2-202ENST00000397063 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
NFE2L2-202ENST00000397063 TOPBP1Q92547 1522 aa21.34■■□□□ 1.01
NFE2L2-202ENST00000397063 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
NFE2L2-202ENST00000397063 TIAM1Q13009 1591 aa21.34■■□□□ 1.01
NFE2L2-202ENST00000397063 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.34■■□□□ 1.01
NFE2L2-202ENST00000397063 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
NFE2L2-202ENST00000397063 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms