RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430047.1

NFE2L2-205, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 2, humanhuman

TSL 3

Gene NFE2L2, Length 451 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L2-205ENST00000430047 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.65■■■■■ 6.66
NFE2L2-205ENST00000430047 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.39■■■■■ 5.66
NFE2L2-205ENST00000430047 ABCC9O60706 1549 aa49.03■■■■■ 5.44
NFE2L2-205ENST00000430047 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.32■■■■■ 5.17
NFE2L2-205ENST00000430047 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.31■■■■■ 5.16
NFE2L2-205ENST00000430047 NACADO15069 1562 aa47.29■■■■■ 5.16
NFE2L2-205ENST00000430047 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.21■■■■■ 5.15
NFE2L2-205ENST00000430047 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.03■■■■■ 5.12
NFE2L2-205ENST00000430047 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.89■■■■■ 5.1
NFE2L2-205ENST00000430047 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.34■■■■■ 5.01
NFE2L2-205ENST00000430047 SCRIBQ14160 1630 aa45.93■■■■■ 4.94
NFE2L2-205ENST00000430047 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.82■■■■■ 4.93
NFE2L2-205ENST00000430047 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.81■■■■■ 4.92
NFE2L2-205ENST00000430047 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.36■■■■■ 4.85
NFE2L2-205ENST00000430047 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.77■■■■■ 4.76
NFE2L2-205ENST00000430047 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.61■■■■■ 4.73
NFE2L2-205ENST00000430047 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.41■■■■■ 4.7
NFE2L2-205ENST00000430047 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.08■■■■■ 4.65
NFE2L2-205ENST00000430047 SMARCA4P51532 1647 aa43.96■■■■■ 4.63
NFE2L2-205ENST00000430047 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.93■■■■■ 4.62
NFE2L2-205ENST00000430047 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.65■■■■■ 4.58
NFE2L2-205ENST00000430047 SMARCA2P51531 1590 aa43.64■■■■■ 4.58
NFE2L2-205ENST00000430047 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.62■■■■■ 4.57
NFE2L2-205ENST00000430047 NCAPD3P42695 1498 aa43.57■■■■■ 4.57
NFE2L2-205ENST00000430047 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.5■■■■■ 4.55
NFE2L2-205ENST00000430047 HMGXB3Q12766 1538 aa43.41■■■■■ 4.54
NFE2L2-205ENST00000430047 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.31■■■■■ 4.52
NFE2L2-205ENST00000430047 WIZO95785 1651 aa43.27■■■■■ 4.52
NFE2L2-205ENST00000430047 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.2■■■■■ 4.51
NFE2L2-205ENST00000430047 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.76■■■■■ 4.44
NFE2L2-205ENST00000430047 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.48■■■■■ 4.39
NFE2L2-205ENST00000430047 NESP48681 1621 aa42.46■■■■■ 4.39
NFE2L2-205ENST00000430047 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.32■■■■■ 4.37
NFE2L2-205ENST00000430047 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
NFE2L2-205ENST00000430047 ERCC6Q03468 1493 aa42.28■■■■■ 4.36
NFE2L2-205ENST00000430047 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.24■■■■■ 4.35
NFE2L2-205ENST00000430047 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.14■■■■■ 4.34
NFE2L2-205ENST00000430047 CFTRP13569 1480 aa42.1■■■■■ 4.33
NFE2L2-205ENST00000430047 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.09■■■■■ 4.33
NFE2L2-205ENST00000430047 PRDM2Q13029 1718 aa42■■■■■ 4.31
NFE2L2-205ENST00000430047 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.85■■■■■ 4.29
NFE2L2-205ENST00000430047 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
NFE2L2-205ENST00000430047 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.79■■■■■ 4.28
NFE2L2-205ENST00000430047 CUX2O14529 1486 aa41.76■■■■■ 4.28
NFE2L2-205ENST00000430047 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.68■■■■■ 4.26
NFE2L2-205ENST00000430047 WDR62O43379 1518 aa41.54■■■■■ 4.24
NFE2L2-205ENST00000430047 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
NFE2L2-205ENST00000430047 ABCC8Q09428 1581 aa41.27■■■■■ 4.2
NFE2L2-205ENST00000430047 TOPBP1Q92547 1522 aa41.2■■■■■ 4.19
NFE2L2-205ENST00000430047 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.2■■■■■ 4.19
NFE2L2-205ENST00000430047 CUX1P39880 1505 aa40.94■■■■■ 4.14
NFE2L2-205ENST00000430047 IFT140Q96RY7 1462 aa40.9■■■■■ 4.14
NFE2L2-205ENST00000430047 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
NFE2L2-205ENST00000430047 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.79■■■■■ 4.12
NFE2L2-205ENST00000430047 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.76■■■■■ 4.12
NFE2L2-205ENST00000430047 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
NFE2L2-205ENST00000430047 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.71■■■■■ 4.11
NFE2L2-205ENST00000430047 SOGA1O94964 1423 aa40.71■■■■■ 4.11
NFE2L2-205ENST00000430047 TOP2BQ02880 1626 aa40.69■■■■■ 4.1
NFE2L2-205ENST00000430047 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.66■■■■■ 4.1
NFE2L2-205ENST00000430047 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
NFE2L2-205ENST00000430047 SYNJ1O43426 1573 aa40.65■■■■■ 4.1
NFE2L2-205ENST00000430047 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.09
NFE2L2-205ENST00000430047 WDR97A6NE52 1622 aa40.51■■■■■ 4.08
NFE2L2-205ENST00000430047 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.47■■■■■ 4.073e-7■■■■□ 26
NFE2L2-205ENST00000430047 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
NFE2L2-205ENST00000430047 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.4■■■■■ 4.06
NFE2L2-205ENST00000430047 PBRM1Q86U86 1689 aa40.25■■■■■ 4.03
NFE2L2-205ENST00000430047 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.25■■■■■ 4.03
NFE2L2-205ENST00000430047 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.25■■■■■ 4.03
NFE2L2-205ENST00000430047 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.24■■■■■ 4.03
NFE2L2-205ENST00000430047 GRIN2BQ13224 1484 aa40.2■■■■■ 4.03
NFE2L2-205ENST00000430047 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.12■■■■■ 4.01
NFE2L2-205ENST00000430047 CHD1O14646 1710 aa40.11■■■■■ 4.01
NFE2L2-205ENST00000430047 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.09■■■■■ 4.01
NFE2L2-205ENST00000430047 OSCARQ8IYS5 282 aa40.09■■■■■ 4.01
NFE2L2-205ENST00000430047 FBLN2P98095 1184 aa40■■■■□ 3.99
NFE2L2-205ENST00000430047 TRIM41Q8WV44 630 aa39.96■■■■□ 3.99
NFE2L2-205ENST00000430047 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.96■■■■□ 3.99
NFE2L2-205ENST00000430047 SYNJ2O15056 1496 aa39.93■■■■□ 3.98
NFE2L2-205ENST00000430047 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.92■■■■□ 3.98
NFE2L2-205ENST00000430047 KIF27Q86VH2 1401 aa39.91■■■■□ 3.98
NFE2L2-205ENST00000430047 ADAMTS12P58397 1594 aa39.84■■■■□ 3.97
NFE2L2-205ENST00000430047 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.78■■■■□ 3.96
NFE2L2-205ENST00000430047 GRIN2AQ12879 1464 aa39.68■■■■□ 3.94
NFE2L2-205ENST00000430047 CUL7Q14999 1698 aa39.68■■■■□ 3.94
NFE2L2-205ENST00000430047 IGF1RP08069 1367 aa39.68■■■■□ 3.94
NFE2L2-205ENST00000430047 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.57■■■■□ 3.93
NFE2L2-205ENST00000430047 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.56■■■■□ 3.92
NFE2L2-205ENST00000430047 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.54■■■■□ 3.92
NFE2L2-205ENST00000430047 CEP170Q5SW79 1584 aa39.49■■■■□ 3.91
NFE2L2-205ENST00000430047 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.48■■■■□ 3.91
NFE2L2-205ENST00000430047 NUP160Q12769 1436 aa39.48■■■■□ 3.91
NFE2L2-205ENST00000430047 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.43■■■■□ 3.9
NFE2L2-205ENST00000430047 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.43■■■■□ 3.9
NFE2L2-205ENST00000430047 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.43■■■■□ 3.9
NFE2L2-205ENST00000430047 ARHGEF11O15085 1522 aa39.4■■■■□ 3.9
NFE2L2-205ENST00000430047 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.29■■■■□ 3.88
NFE2L2-205ENST00000430047 EEA1Q15075 1411 aa39.28■■■■□ 3.88
NFE2L2-205ENST00000430047 SHROOM2Q13796 1616 aa39.22■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms