Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTNP21246 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTNP21246 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTNP21246 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTNP21246 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTNP21246 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTNP21246 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTNP21246 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTNP21246 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTNP21246 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTNP21246 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTNP21246 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTNP21246 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTNP21246 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTNP21246 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTNP21246 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTNP21246 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTNP21246 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTNP21246 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTNP21246 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTNP21246 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTNP21246 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTNP21246 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTNP21246 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTNP21246 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTNP21246 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTNP21246 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTNP21246 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTNP21246 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTNP21246 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTNP21246 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTNP21246 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTNP21246 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTNP21246 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTNP21246 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTNP21246 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTNP21246 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTNP21246 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTNP21246 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTNP21246 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTNP21246 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTNP21246 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTNP21246 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTNP21246 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTNP21246 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTNP21246 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTNP21246 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTNP21246 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTNP21246 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTNP21246 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTNP21246 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTNP21246 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTNP21246 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTNP21246 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTNP21246 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTNP21246 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTNP21246 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTNP21246 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTNP21246 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTNP21246 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTNP21246 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTNP21246 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTNP21246 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTNP21246 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTNP21246 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTNP21246 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTNP21246 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTNP21246 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTNP21246 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTNP21246 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTNP21246 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTNP21246 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTNP21246 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTNP21246 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTNP21246 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms