Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MTHFD1P11586 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFD1P11586 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms