Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB3P05106 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms