Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TK1P04183 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TK1P04183 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TK1P04183 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TK1P04183 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TK1P04183 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TK1P04183 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TK1P04183 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TK1P04183 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TK1P04183 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TK1P04183 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TK1P04183 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TK1P04183 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TK1P04183 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TK1P04183 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TK1P04183 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TK1P04183 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TK1P04183 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TK1P04183 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TK1P04183 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TK1P04183 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TK1P04183 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TK1P04183 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TK1P04183 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TK1P04183 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TK1P04183 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TK1P04183 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TK1P04183 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TK1P04183 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TK1P04183 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TK1P04183 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TK1P04183 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TK1P04183 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TK1P04183 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TK1P04183 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TK1P04183 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TK1P04183 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TK1P04183 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TK1P04183 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TK1P04183 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TK1P04183 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TK1P04183 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TK1P04183 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TK1P04183 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TK1P04183 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TK1P04183 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TK1P04183 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TK1P04183 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TK1P04183 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TK1P04183 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TK1P04183 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TK1P04183 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TK1P04183 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TK1P04183 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TK1P04183 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TK1P04183 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TK1P04183 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TK1P04183 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TK1P04183 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TK1P04183 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TK1P04183 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TK1P04183 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TK1P04183 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TK1P04183 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TK1P04183 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TK1P04183 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TK1P04183 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TK1P04183 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TK1P04183 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TK1P04183 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TK1P04183 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TK1P04183 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TK1P04183 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TK1P04183 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TK1P04183 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TK1P04183 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TK1P04183 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TK1P04183 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TK1P04183 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TK1P04183 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TK1P04183 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TK1P04183 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TK1P04183 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TK1P04183 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TK1P04183 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TK1P04183 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TK1P04183 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TK1P04183 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TK1P04183 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TK1P04183 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TK1P04183 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TK1P04183 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TK1P04183 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TK1P04183 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TK1P04183 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TK1P04183 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TK1P04183 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TK1P04183 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TK1P04183 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TK1P04183 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms