Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNSO60931 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNSO60931 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNSO60931 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNSO60931 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNSO60931 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNSO60931 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNSO60931 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNSO60931 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNSO60931 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNSO60931 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNSO60931 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNSO60931 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNSO60931 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTNSO60931 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNSO60931 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNSO60931 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNSO60931 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNSO60931 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNSO60931 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNSO60931 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNSO60931 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNSO60931 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNSO60931 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNSO60931 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNSO60931 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNSO60931 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNSO60931 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNSO60931 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNSO60931 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNSO60931 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNSO60931 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNSO60931 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNSO60931 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNSO60931 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTNSO60931 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNSO60931 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNSO60931 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNSO60931 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNSO60931 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNSO60931 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNSO60931 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNSO60931 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNSO60931 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTNSO60931 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTNSO60931 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTNSO60931 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNSO60931 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNSO60931 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNSO60931 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNSO60931 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNSO60931 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNSO60931 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNSO60931 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNSO60931 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNSO60931 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNSO60931 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNSO60931 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNSO60931 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTNSO60931 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNSO60931 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNSO60931 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNSO60931 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNSO60931 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNSO60931 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNSO60931 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNSO60931 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNSO60931 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNSO60931 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNSO60931 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTNSO60931 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNSO60931 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNSO60931 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNSO60931 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNSO60931 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNSO60931 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNSO60931 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNSO60931 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNSO60931 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNSO60931 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNSO60931 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNSO60931 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNSO60931 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNSO60931 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNSO60931 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNSO60931 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNSO60931 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNSO60931 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNSO60931 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNSO60931 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNSO60931 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNSO60931 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNSO60931 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNSO60931 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNSO60931 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNSO60931 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNSO60931 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNSO60931 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNSO60931 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNSO60931 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms