Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SPAG9O60271 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
SPAG9O60271 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SPAG9O60271 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SPAG9O60271 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SPAG9O60271 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SPAG9O60271 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SPAG9O60271 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SPAG9O60271 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SPAG9O60271 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SPAG9O60271 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SPAG9O60271 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SPAG9O60271 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SPAG9O60271 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SPAG9O60271 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SPAG9O60271 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SPAG9O60271 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SPAG9O60271 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SPAG9O60271 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SPAG9O60271 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms