Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
N4BP3O15049 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms