Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT87PA6NCN2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms