Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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