Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TNIKQ9UKE5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TNIKQ9UKE5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TNIKQ9UKE5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms