Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CDK12Q9NYV4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CDK12Q9NYV4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms