Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDAP2Q9NXN4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDAP2Q9NXN4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms