Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NECAP2Q9NVZ3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NECAP2Q9NVZ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms