Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SARS2Q9NP81 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SARS2Q9NP81 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SARS2Q9NP81 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SARS2Q9NP81 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SARS2Q9NP81 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SARS2Q9NP81 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SARS2Q9NP81 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SARS2Q9NP81 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SARS2Q9NP81 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SARS2Q9NP81 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SARS2Q9NP81 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SARS2Q9NP81 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SARS2Q9NP81 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SARS2Q9NP81 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SARS2Q9NP81 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SARS2Q9NP81 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SARS2Q9NP81 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SARS2Q9NP81 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SARS2Q9NP81 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms