Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEBOXQ9HB31 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEBOXQ9HB31 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEBOXQ9HB31 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEBOXQ9HB31 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms