Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA90

EFCC1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCC1Q9HA90 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFCC1Q9HA90 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFCC1Q9HA90 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFCC1Q9HA90 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFCC1Q9HA90 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFCC1Q9HA90 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFCC1Q9HA90 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFCC1Q9HA90 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFCC1Q9HA90 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EFCC1Q9HA90 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFCC1Q9HA90 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFCC1Q9HA90 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFCC1Q9HA90 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFCC1Q9HA90 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFCC1Q9HA90 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFCC1Q9HA90 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFCC1Q9HA90 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFCC1Q9HA90 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFCC1Q9HA90 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFCC1Q9HA90 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFCC1Q9HA90 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFCC1Q9HA90 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFCC1Q9HA90 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EFCC1Q9HA90 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EFCC1Q9HA90 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 311.9 ms