Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GORASP1Q9BQQ3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GORASP1Q9BQQ3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms