Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
WDR53Q7Z5U6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms