Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT24Q2M2I5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT24Q2M2I5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT24Q2M2I5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT24Q2M2I5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KRT24Q2M2I5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KRT24Q2M2I5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KRT24Q2M2I5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT24Q2M2I5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT24Q2M2I5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT24Q2M2I5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT24Q2M2I5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT24Q2M2I5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT24Q2M2I5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT24Q2M2I5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT24Q2M2I5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT24Q2M2I5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT24Q2M2I5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT24Q2M2I5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT24Q2M2I5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT24Q2M2I5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT24Q2M2I5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT24Q2M2I5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT24Q2M2I5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT24Q2M2I5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT24Q2M2I5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT24Q2M2I5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT24Q2M2I5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT24Q2M2I5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT24Q2M2I5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT24Q2M2I5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT24Q2M2I5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT24Q2M2I5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms