Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ME3Q16798 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ME3Q16798 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ME3Q16798 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ME3Q16798 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ME3Q16798 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ME3Q16798 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ME3Q16798 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ME3Q16798 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ME3Q16798 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ME3Q16798 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ME3Q16798 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ME3Q16798 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ME3Q16798 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ME3Q16798 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ME3Q16798 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ME3Q16798 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ME3Q16798 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ME3Q16798 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ME3Q16798 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ME3Q16798 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ME3Q16798 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ME3Q16798 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ME3Q16798 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ME3Q16798 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ME3Q16798 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ME3Q16798 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ME3Q16798 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ME3Q16798 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ME3Q16798 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ME3Q16798 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ME3Q16798 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ME3Q16798 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ME3Q16798 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ME3Q16798 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ME3Q16798 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ME3Q16798 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ME3Q16798 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ME3Q16798 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME3Q16798 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME3Q16798 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME3Q16798 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME3Q16798 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME3Q16798 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ME3Q16798 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ME3Q16798 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME3Q16798 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ME3Q16798 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME3Q16798 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME3Q16798 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME3Q16798 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME3Q16798 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME3Q16798 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME3Q16798 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME3Q16798 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME3Q16798 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ME3Q16798 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ME3Q16798 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ME3Q16798 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ME3Q16798 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ME3Q16798 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ME3Q16798 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ME3Q16798 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ME3Q16798 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ME3Q16798 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ME3Q16798 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ME3Q16798 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ME3Q16798 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ME3Q16798 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ME3Q16798 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ME3Q16798 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ME3Q16798 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ME3Q16798 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ME3Q16798 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ME3Q16798 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ME3Q16798 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ME3Q16798 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ME3Q16798 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ME3Q16798 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ME3Q16798 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ME3Q16798 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ME3Q16798 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ME3Q16798 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ME3Q16798 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ME3Q16798 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ME3Q16798 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ME3Q16798 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ME3Q16798 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ME3Q16798 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ME3Q16798 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ME3Q16798 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ME3Q16798 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ME3Q16798 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ME3Q16798 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ME3Q16798 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ME3Q16798 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ME3Q16798 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ME3Q16798 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ME3Q16798 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ME3Q16798 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms